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Análisis in silico de genes de resistencia antibiótica enbacterias de fuentes hídricas bolivianas
(2025) Winder Felipez
El estudio analizó in silico los genes de resistencia a antibióticos (ARGs) en fuentes de agua en Bolivia, enfocándose en identificar los genes presentes y su relación filogenética con microorganismos. Se utilizaron herramientas bioinformáticas para evaluar la diversidad de ARGs en varias especies bacterianas, incluyendo Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa y Vibrio cholerae, entre otras. Se seleccionaron 13 especies bacterianas de importancia clínica, ambiental e industrial, y se identificaron los genes de resistencia más comunes, como blaTEM, blaOXA, tetA y intI1. Los resultados revelaron una amplia diversidad de ARGs en fuentes de agua de Bolivia, especialmente en cuerpos como el Río La Paz y el Lago Alalay, reflejando la contaminación por aguas residuales y actividades industriales. El análisis filogenético, mostró una evolución divergente de los genes de resistencia, con clados como blaOXA y ampC mostrando una gran variabilidad. Estos hallazgos , subrayan la importancia de monitorear las diversas fuentes de agua en Bolivia para evaluar el impacto de la contaminación y su relación con la propagación de la resistencia antimicrobiana. La investigación también destaca la necesidad de políticas de manejo de recursos hídricos para mitigar este problema.
Contribution of trees to carbon stocks in urban–rural ecosystems: Taxonomic, phylogenetic, and functional diversity in response to bioclimatic and geographic factors
(National University of Trujillo, 2025) Martha Serrano Pacheco; Josue Bejarano Chumacero; Reinaldo Lozano Ajata; Manuel Horacio Jiménez Huamán; Winder Felipez
Tree diversity plays a key role in mitigating climate change and enhancing ecosystem resilience. This study evaluated the contribution of trees across three habitats within the urban–rural gradient of Sucre, Bolivia: urban (UF), native (NF), and exotic (EF). Carbon sequestration, as well as taxonomic (TD), phylogenetic (PD), and functional (FD) diversity, were analyzed in relation to bioclimatic (temperature and precipitation) and geographic (altitude) factors. The methodology included the recording of botanical and ecological traits, along with the measurement of dendrometric classes (DBH ≥ 10 cm) in 12 temporary circular plots per habitat. Results showed higher carbon stocks in the urban forest (268.36 ± 2.76 MgC/ha), followed by the exotic (159.53 ± 0.86 MgC/ha) and the native forest (39.64 ± 0.41 MgC/ha). A total of 31 species from 19 families were identified, with marked evolutionary divergence between Pinaceae and Cupressaceae compared to Fabaceae. The urban habitat presented the highest taxonomic diversity (~51.6%), the highest phylogenetic diversity (~72%), and the greatest carbon fixation (~42%). These findings highlight the fundamental role of tree diversity in carbon sequestration, biodiversity conservation, and landscape connectivity, emphasizing the need to integrate it into sustainable urban–rural planning through adaptation and mitigation strategies that strengthen ecological resilience and ecosystem services in the urban–rural ecosystem of Sucre.
Genome-wide identification and functional analysis of heat shock transcription factors in Amaranthus tricolor cv. red
(Springer Science+Business Media, 2026) Ramiro Orellana; Jennifer Villavicencio; Eloy Fernández; Valéria Oliveira Nizolli; Wilson Siñaniz; Winder Felipez
Genome-Wide Identification of Bilberry WRKY Transcription Factors: Go Wild and Duplicate
(Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2023) Winder Felipez; Jennifer Villavicencio-Huamani; Valéria Oliveira Nizolli; Camila Pegoraro; Luciano Carlos da Maia; Antônio Costa de Oliveira
WRKY transcription factor genes compose an important family of transcriptional regulators that are present in several plant species. According to previous studies, these genes can also perform important roles in bilberry (Vaccinium myrtillus L.) metabolism, making it essential to deepen our understanding of fruit ripening regulation and anthocyanin biosynthesis. In this context, the detailed characterization of these proteins will provide a comprehensive view of the functional features of VmWRKY genes in different plant organs and in response to different intensities of light. In this study, the investigation of the complete genome of the bilberry identified 76 VmWRKY genes that were evaluated and distributed in all twelve chromosomes. The proteins encoded by these genes were classified into four groups (I, II, III, and IV) based on their conserved domains and zinc finger domain types. Fifteen pairs of VmWRKY genes in segmental duplication and four pairs in tandem duplication were detected. A cis element analysis showed that all promoters of the VmWRKY genes contain at least one potential cis stress-response element. Differential expression analysis of RNA-seq data revealed that VmWRKY genes from bilberry show preferential or specific expression in samples. These findings provide an overview of the functional characterization of these proteins in bilberry.
Nematode diversity associated with coconut biotypes in the Dominican Republic
(Springer Science+Business Media, 2025) Marianela Conce; Winder Felipez; Socorro García Pantaleón; Juan de Dios Moya Franco; Cristina Antonia Gómez Moya; Jerônimo Vieira de Araújo Filho
Retos y soluciones en el manejo de nematodos fitoparásitos en el cultivo de banana (Musa spp.)
(2024) Marianela Conce; Socorro Garcia-Pataleón; Daniel Gutiérrez; Enrique Murillo; Winder Felipez
El cultivo de banano (Musa spp.) es fundamental para la seguridad alimentaria y la economía global, especialmente en lugares como República Dominicana y Puerto Rico donde enfrenta grandes desafíos debido a los nematodos fitoparásitos, como Radopholus similis y Helicotylenchus multicinctus, que afectan el sistema radicular y reducen los rendimientos hasta en un 20%. Aunque históricamente se han utilizado nematicidas químicos, las preocupaciones ambientales y su limitada efectividad a largo plazo han impulsado la búsqueda de alternativas más sostenibles. Este estudio analiza diversas estrategias agroecológicas para manejar estos nematodos, como el uso de microorganismos antagonistas (hongos y bacterias), la incorporación de compost y vermicomposta, y el mejoramiento genético mediante variedades resistentes como FB920 y Pisang Lilin. El aporte del análisis y discusión, hacen referencia que estas prácticas no solo reducen las poblaciones de nematodos, sino que también mejoran la salud del suelo y aumentan los rendimientos. Por tanto, un enfoque integrado que combine agroecología y mejoramiento genético ofrece una solución sostenible y eficaz para el manejo de nematodos en el cultivo de banano.