Efecto de la salinidad sobre la composición de las comunidades bacterianas de la rizosfera de fabiana densa

Abstract

Las comunidades bacterianas de la rizósfera tienen una gran red de interacción entre microorganismos, el suelo y la planta. Estas comunidades pueden mejorar la resistencia de las plantas a factores estresantes, como la salinidad, que es característico del Altiplano Boliviano. Con el objetivo de determinar el efecto de un gradiente de salinidad sobre las comunidades bacterianas de la rizósfera de Fabiana densa, se sometieron plantines a riego con soluciones de NaCl 0, 15, 25 y 40 mM, bajo condiciones controladas. Se realizó la extracción de ADN, la amplificación de la región V4 del gen ARNr 16S y la secuenciación en la plataforma MiSeq Illumina. Los análisis bioinformáticos iniciales se realizaron en QIIME2 y los análisis estadísticos se realizaron en R. El tiempo de muestreo dio efectos significativos sobre ASV observados, el índice inverso de Simpson, el índice de Shannon y el índice de diversidad filogenético de Faith. Los taxones que se correlacionaron positivamente con el gradiente de salinidad son Cellvibrionaceae, Cyclobacteriaceae, Shewanellaceae, TRA3.20, Devosiaceae, Gemmatimonadaceae, Halieaceae, Prolixibacteraceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Rhizobiales Incertae Sedis, Spongiibacteraceae, Thermoanaerobaculaceae, Chitinophagales y Xanthomonadaceae. Algunos de los taxones diferencialmente abundantes respecto a los tratamientos de salinidad son Shewanella, Rheinheimera, Cellvibrio, Pseudomonas, Luteimonas, Hydrogenophaga, Dokdonella, Bauldia y Algoriphagus